转录组分析怎么做(什么是转录组分析)
您好,今天小花就为大家解答关于转录组分析怎么做,什么是转录组分析相信很多小伙伴还不知道,现在让我们一起来看看吧!
1、转录组分析指对细胞内所有转录产物的集合的分析。
2、转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。
3、转录组测序一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高通量测序。
4、相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。
5、扩展资料:转录组测序的技术路线:样品要求:样品纯度要求: total RNA OD值应在1.8至2.2之间;电泳检测28S:18S至少大于1.5。
6、2、样品浓度: total RNA浓度不低于400ng/ul;样品总量不低于15ug;目前最新的样品建库要求降低到1ug,浓度大于50ng/ul即可。
7、3、提供total RNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。
8、请同时附上QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。
9、如需进行多次样品制备,需要提供多次样品制备所需样品。
10、参考资料来源:百度百科——转录组。
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